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控股股東中國國航披露的年報指出，儘管公司營運收入同比增長16%至31.1億元人民幣，但財務壓力仍未緩解。
近五年（2020-2024）累計虧損達37億元人民幣，與前十年（2010-2019）累計盈利17億元形成強烈反差。營運方面呈現復甦跡象，2024年客運量321萬人次，同比增長56.41%，已恢復至2019年水平的87.7%。航班載客率提升至74.59%，收益客公里（RPK）和可用座位公里（ASK）分別增長59.5%和53.23%，顯示市場需求回升速度超過運力擴張。
目前澳門航空擁有23架全空巴機隊，平均機齡8.54年，總資產估值約55.6億元人民幣。面對持續財務困境，澳門特區政府計劃2025年注資3.44億澳門元（約合3.1億元人民幣）。據悉，這是該公司自2009年以來第四次獲得主要股東資金援助。
立法會資料顯示，澳門航空目前淨資產值已低於股本半數，面臨流動性緊張與償債壓力。此次注資旨在協助公司改善營運狀況，維持航空服務穩定。
