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從通關分佈來看，港澳大廳、珠澳大廳及車道通關客流佔比分別為50.5%、15%及34.5%。在通關人員結構方面，澳門居民佔比32.3%，外地僱員佔2.5%，內地旅客佔28.9%，香港旅客佔28.3%，台灣地區人士佔0.5%，外籍旅客則佔7.1%。值得關注的是，該口岸驗放外籍旅客的比例位居澳門各口岸之首，高達35.9%，突顯港珠澳大橋口岸發揮着連接國際交往的重要作用。
「澳車北上」和「港澳跨境私家車」等政策的實施，推動了港珠澳大橋澳門口岸的車流及客流量增長。2024年，治安警察局在該口岸新增兩條入境車道，並在出入境車道增設隨車人員驗放廳，以提升通關效率。
2024年7月19日，澳門與香港推出「港澳通關互用二維碼服務」。2025年1月至4月，共有36萬人次香港居民使用該服務出入境澳門，其中65%經港珠澳大橋澳門口岸通行。
澳門治安警察局表示，將繼續優化口岸通關設施，擴大自助通關服務的適用範圍，進一步便利外籍旅客及香港居民通行，以配合粵港澳大灣區的發展需求。
