儘管莫桑比克政府宣布，將在學校的衛生基礎上投放資金，並承諾在條件允許的情況下，讓學生能夠在本學年12月結束前能夠恢復面授的課程。然而，根據聯合國兒童基金會對該國評估的最新報告，認為這個目標在實現將上遇到很大的困難。
目前，莫桑比克約一半的中學沒有廁所，只有一半可以使用公共供水系統。作為教育部正在草擬的調查部分，本月初發布的聯合國兒童基金會關於該國的最新報告數據顯示，透過實地收集的信息，可見由於許多學校沒有適合的衛生條件，莫桑比克面臨著復課的困難，更毋庸說學校可採取更多的防疫消毒工作。
聯合國兒童基金會致力推廣「水、環境衛生和個人衛生」（英文縮寫為WASH，即Water, Sanitation和 Hygiene三個字的字首組合縮寫）的干預措施。聯合國的目標是鼓勵政府「確保在所有學校中安裝盥洗設備」，以便學校能夠順利復課之餘，又能達到健康安全的標準。聯合國兒童基金會6月時發布的報告指出：「封閉學校的時間越長，小朋友失去學習的時間就越多，尤其是女童，時間越久，她們不能重返校園的機會就越大。」聯合國兒童基金會副代表卡塔琳娜·約翰遜（Katarina Johansson）表示： 「要復課，就必須要在良好的計劃基礎上進行，以確保學生和老師可以完全安全，從而避免在學校中感染冠狀病毒。」
疫情原因，莫桑比克學校關閉大門的時間比其他國家都要多。莫桑比克在開學一個月未夠便宣布陷入疫情，3月底起對全國實施管制，並隨即宣布進入緊急狀態，包括所有學校、所有年級被迫關閉，只能透過遠程學習繼續課堂上的安排。然而，莫桑比克，作為全球最貧窮的國家之一，許多人別說家居網絡，甚至電視也未必有，特別是在莫桑比克偏遠郊區部分，人民經濟條件十分有限。今年六月底，莫桑比克總統紐西（Filipe Nyusi）宣布，解封學校，但由於衛生條件欠佳，宣佈幾週不久後他便撤回法令。因此，對於如何能夠針對不同年級的學生安排復課，仍處於計劃階段。
莫桑比克政府宣佈，自8月18日起，允許在高等院校復課，允許進行低風險的社交活動，同時允許舉行最多50人的宗教活動進行。高等院校班級較小，每個班級都嘗試遵循一系列的預防措施，包括保持社交距離和勤洗雙手。
9月7日起，緊急狀態除下，但仍保持著公共災難狀態。被視為「高風險」的活動計劃，包括12年級課程（相等於高中三年級），將於10月1日起回復正常。 在正式復課前，小學和中學須接受省級衛生部門和教育機構的檢查，但目前尚未有確定的日期，這些措施同時適用於公立和私立學校。
直接取消學年？
聯合國在最新的報告中指：「聯合國兒童基金會向教育部提供財政支持，以遠距的方式準備廣播和電視節目。」該報告還著重強調：「政府需要進行艱鉅的工作，以符合聯合國教科文組織的程序規定，好讓學校可以重新開學。」 但是，對此人們越來越抱有悲觀的態度。非政府民間組織公眾誠信中心（CIP）建議，莫桑比克政府評估直接取消學年的可能性，並利用12月之前的時間作出可能的改進，以使2021年的復課更為安全。
現時莫桑比克的公共教育體系中，約有13,300間小學和670間中學。莫桑比克政府在7月宣布，將計劃投資35億梅蒂卡爾（約4,400萬歐元左右）對學校開展重建工程，並冀學校可以分階段復課。但是，公眾誠信中心要求政府應制定詳細的計劃，以便作出更深入的干預。中心負責人認為，當前的教育系統結構，不能保證僅僅修復和更換水和衛生基礎設施，便足以防止大規模的污染。
尋求決定性指標
非洲聯盟疾病預防控制中心主任約翰·恩肯加松（John Nkengasong）在本月初時表示：「倘若疫情仍尚十分活躍，復課是沒有意義的。」他說，只有感染確診率低於5％的時候，才有可能復課。根據分析，在莫桑比克，可以共識訂立一個指標的數字，以指示下一步的政策推行。聯合國兒童基金會的報告亦指：「新冠疫情在非洲大陸上正在蔓延，檢測確診的陽性比率從5％增加到7％。」
與此同時，衛生部正在各地區省會作血清流行病學上的調查。在首都馬普托的一項調查顯示，年齡介乎於60歲或以上的人士，血清陽性比率更高（4.48％），而35至59歲年齡段的血清陽性率則最低，只有3.03％。 調查還發現，確診感染的患者中有70.62％沒有明顯症狀。
莫桑比克衛生部在8月宣布，馬普托市成為全國繼卡波·德爾加多和納姆普拉後，發生社區爆發的城市，因為該城市陽性確診個案多，病例分散分佈和感染狀況的變化亦較複雜。截至9月6日為止，莫桑比克累計處理約4,500例感染病例，並錄得27例死亡。究竟這些數字是否將有助於在本學年的結果作出新的決定，仍有待觀察。
如果全交由莫桑比克的前教育部長，馬普托教育大學（國立）的校長Jorge Ferrão來處理的話，那就永遠都不用復課了。他曾在7月份的一次採訪中表示：「在楠普拉（Nampula）和卡波·德爾加多（Cabo Delgado）的社區爆發後，我認為首先我們要照顧好自己，減少病毒在社區內蔓延，待一切穩定後再復課。」學校管理部門或可控制學生在校園內的行為，採取防疫措施防止病毒傳播，但是學生到了外面，學校無法監督，更不用說在家庭與學校之間的關係，反之亦然。
他重申：「我們不能控制學生所有所到之處。在巴士站，人多了，沒有了社交距離，公共交通亦會承受一定的風險。」他認為，這場疫情以更敏銳的方式揭示了莫桑比克學校基礎設施的不足，表明了資金投入的迫切性。
