澳廣視葡文電台訪問澳門生態學會會長何偉添時表示，生態島項目有可能違反中央政府的《中華人民共和國野生動物保護法》，即使特區政府向中央提交的報告表示該項目對中華白海豚的生活沒有影響，該報告亦只是研究單位的結論，若報告未得到國家主管機關認可，生態島項目將不會被中央政府接受。
立法議員林宇滔26日在立法會口頭質詢時，敦促政府交代生態島建造和選址的科學數據。運輸工務司司長羅立文則重申，生態島的選址及建設與否，是經內地專家論證、研究、分析，將根據專家結論決定是否興建。「如果個結論係唔得，我哋一定唔做，如果個結論係得，我哋就會做。」
環保局長譚偉文則表示，正就生態島進行一個論證及4個評價，包括海域使用論證、通航影響評價、防洪影響評價、環境影響評價等，會按國家標準，透過科學性態度研究及論證，包括會對中華白海豚部分做深入研究論證，要待論證和影響評價完成後提交中央報批，才有相應較實質的時間表。
環保局長譚偉文稱：「中央部委也有給予意見，生態島希望分兩期進行，我們預計兩期使用年限各10年，第一期先用10年，再到第二期用另外10年；一旦建好生態島，現時的建築廢料堆填區會重新規劃把土地考慮重新利用。」
澳廣視葡文電台訪問澳門生態工作者關學然表示，中山大學的研究報告結果顯示，生態島計劃將增加中華海豚種族滅絕的風險。他舉例，早前有橫琴機構計劃在「生態島」選址附近填海，但最終廣東省政府不予填海，他認為中央有可能也不會批准項目。
另據澳廣視葡文頻道取得被列為「機密」文件的《澳門管理水域中華白海豚調查報告(2020-2021)》報導，該報告顯示，在澳門海域至少有144隻海豚。該群體主要是年輕個體，牠們分為多個社群，而澳門管理水域是連接珠江口社群極為重要的棲息地。
中山大學的報告建議在澳門設立一個面積超過36平方公里的白海豚保護區，該保護區涵蓋計劃建造生態島的選址。
