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檢方指出，案件屬戰後前所未有的重大犯罪，不僅造成一名前首相死亡，亦對社會帶來深遠影響。檢方強調，被告在多人聚集的街頭演說場合使用自製槍枝行兇，犯行極度危險，且早於案發約1年半前已開始以殺害為目的製造武器，期間多次試作並改良性能，顯示高度計畫性與預謀性，因此主張判處無期徒刑。
辯方則請求從輕量刑，認為案件應放在宗教相關長期受害的背景下檢視。辯方指出，被告母親成為「世界和平統一家庭聯合會」信徒後，長年捐獻鉅額款項，累計超過1億日圓，最終導致家庭破產，對被告成長造成深層影響。辯方主張，案件是長期宗教問題累積後引發的結果，即使科處最重刑罰，也應限制在20年以內。
檢方回應指出，雖不否認被告成長歷程中的不幸，但其犯罪行為顯示對生命的極度輕視，且犯案結果重大，不應因此大幅減輕刑責。
案件於2025年10月28日開庭，被告在審理過程中承認殺害安倍的事實。審理期間，包括被告母親、妹妹及宗教社會學者在內共12人出庭作證，連同宣判在內共進行16次庭審。45歲的山上徹也被控5項罪名，安倍晉三當年在奈良市發表輔選演說時遭槍擊，送醫後不治，終年67歲。
