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根據公佈的信息，車長小於六米的八座和九座及以下小型客車每次通行將收取66元人民幣。
根據廣東省價格成本調查隊的成本監審規定，對深中通道車輛通行費進行成本監審。監審結果顯示，深中通道專案的十五年收費期間年平均成本約為22.45億元人民幣，年均標準車流量超過3,791萬架次。標準車（小客車）在全線通行的單位平均成本每次為59.22元，其中東島至西島段為33.34元，西島至萬頃沙互通段為20.32元，萬頃沙互通至橫門互通段為5.56元。、
聽證方案一，深中通道項目全線車輛通行費的收費標準如下：對於標準車次，收費標準為每次66元，並按照全省高速公路統一的車型分類方式和收費系數執行。對於三類客車和四類客車，收費係數將按照現行系數的65%執行，收費標準均為每次86元。
聽證方案二，深中通道項目全線車輛通行費的收費標準如下：對於標準車次，收費標準為每次66元，並按照全省高速公路統一的車型分類方式和收費系數執行。對於四十座以上的大型客車和六類及以上的貨車（包括六類以上的專項專業車），收費系數將按照現行系數的80%執行，其收費標準分別為每次106元和216元。
全長24公里的深中通道主線已於去年11月28日全線貫通，並計劃今年6月具備通車條件，屆時深圳至中山的車程亦將縮短至半小時之內。近日，深中通道完成鋼橋面鋪裝，下一步將開始海底隧道內混凝土瀝青路面施工。
