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新通關車道採用「合作查驗，一次放行」的聯合一站式查驗模式，出入境車輛只需一次排隊，一次放行。澳門保安司司長辦公室指橫琴口岸二期工程建設的整體安排，客貨車聯合一站式查驗的部分車道已完成建設，經兩地協商後決定於下周二15時起試行。屆時蓮花大橋全線恢復通車，原通關車道暫停使用，出入境的行車路線及查驗模式均有改變。澳門大學連接橫琴口岸通道橋車道亦於同日開通，惟人行道受舊交通平台整改工程影響暫未能使用。
隨車乘客仍需經旅檢大廳出入境，而不具通關資格的汽車可到澳門口岸區接送乘客。由於口岸一層隨車人員驗放廳尚未完成建設，故隨車乘客仍需經旅檢大廳出入境，但原准予隨車通關乘客（例如70歲或以上長者、10歲或以下兒童、孕婦及殘障人士）的準則和安排維持不變。因應蓮花大橋恢復通車，一般車輛可到澳門口岸區接送乘客，駕駛者亦可取道口岸進入澳門大學橫琴校區。
現時橫琴口岸只容許「粵澳兩地牌車輛」以及「獲准進出橫琴的澳門單牌車」通關，「澳車北上」之車輛仍只能經港珠澳大橋人工島口岸通關。此外，因應車道試行，兩條巴士路線701X和N6將有調整。
