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啟用後，橫琴粵澳深度合作區綜合服務中心主辦事廳、綜合服務中心稅務分廳、綜合服務中心公安分廳（部分業務）將整體搬遷至政務服務中心，地址為橫琴港澳大道868號市民服務中心2號樓政務服務中心。對外辦公時間為周一至周五（法定節假日除外）：上午9時至中午12時，下午2時至6時。
自政務服務中心啟用之日（2023年9月11日）起，業務辦理安排如下：橫琴粵澳深度合作區綜合服務中心原主辦事廳（地址：橫琴寶興路189號1棟）、稅務分廳（地址：橫琴金融產業發展基地三期5號樓）、公安分廳（地址：橫琴寶華路16號一樓），不再受理業務。
位於環島東路3018號國際商務中心北塔一樓175號、橫琴寶興路189號3棟的公安分廳，位於順境路與祥澳路交叉路口往東100米（橫琴口岸附近）的口岸分廳繼續正常辦理業務。
