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馬英九到大陸祭祖並率團交流，下午飛抵上海，並到南京。中共中央台辦、上海市委有關負責人到機場迎接。
但恰巧撞上外交部昨剛宣布我國和宏都拉斯斷交，時機敏感，訪中後續效應以及雙邊互動引發關注。對此，馬英九啟程前在桃園機場簡短發表談話表示，「這是我第一次到中國大陸訪問，事實上在我37歲時，在政府裡面負責處理兩岸事務，我今年73歲，等了36年才有機會到大陸去訪問，的確是久了一點。」
73歲的馬英九將在大陸逗留 12天，帶領台灣學生到訪武漢、長沙、重慶等地。他出發前在機場發表講話，稱自己 37歲時負責處理兩岸事務，等了 36年方有機會首訪大陸，除祭祖外，亦期望透過兩岸年青人的熱情互動，改善目前的兩岸氛圍，令和平更快到來。
在北京，國台辦早前稱，兩岸青年加強交流交往，能為兩岸關係和平發展增添新生力量，大陸方面歡迎馬英九來訪。
