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《橫琴粵澳深度合作區建設總體方案》（以下簡稱《總體方案》）提出，合作區的民商事規則銜接澳門、接軌國際，營造趨同澳門及國際的宜居宜業法律制度環境，提升對澳門居民及國際人才的吸引力。為配合合作區建設，特區政府需要在部分領域制定或修訂相關法律法規，現正展開深入研究。此外，還將加強粵澳司法交流協作，建立完善的國際商事審判、仲裁、調解等多元化商事糾紛解決機制。
《總體方案》在法律方面的規定針對性強，符合合作區建設的實際需要。特區將與廣東方面同心協力，從法治完善方面推進合作區的建設。
立法方面，《總體方案》提出研究制定合作區條例，為合作區長遠發展提供制度保障；用足用好經濟特區立法權，允許珠海立足合作區改革創新實踐需要，根據授權對法律、行政法規、地方性法規作變通規定。此外，合作區可向全國人大或其常委會、國務院申請授權，根據需要調整現行法律或行政法規，以實施有關改革開放政策措施。上述法律層面的“頂層設計”，將為合作區改革創新提供充足的法律手段。為配合合作區的建設，特區政府需要在部分領域制定或修訂相關法律法規，正在進行深入研究。
除了澳門大學橫琴校區和橫琴口岸澳門管轄區外，合作區均受內地法律管轄，相關法律規則與澳門及國際有不少差異，澳門居民及國際人才到合作區生活、就業、創業，可能遇到規則制度不適應的問題。就此，《總體方案》提出，合作區的民商事法律規則要銜接澳門、接軌國際，以營造趨同澳門及國際的宜居宜業制度環境，提升對澳門居民及國際人才的吸引力。
隨著合作區建設的推進，粵澳兩地的經濟和人員交流將更加頻繁，亦可能會產生愈來愈多的各類糾紛，有需要提供適切的糾紛解決機制。因此，《總體方案》要求加強粵澳司法交流協作，建立完善國際商事審判、仲裁、調解等多元化商事糾紛解決機制。《總體方案》還提出，要強化橫琴新區法院的職能和作用，為合作區建設提供高效便捷的司法服務和保障。
