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統計數據顯示，珠海邊檢總站的年查驗出入境人數從1999年的3,180萬人次增長至今年的逾1.87億人次，查驗出入境的交通工具也由1999年的162萬輛（艘）次增至1,027萬輛（艘）次。
在通關基礎設施方面，25年間珠海和澳門之間的口岸數量從1999年的2個增至7個，人工查驗通道數量由不到100條增長至現在的166條，快捷查驗通道則從零增至469條，車輛“一站式”查驗通道更從零增至123條。
為進一步提高通關效率，珠海和澳門在2018年起先後實施「合作查驗、一次放行」的邊檢模式，並在港珠澳大橋珠海公路口岸珠澳通道、橫琴和青茂口岸推行，截至目前，已有超過1.45億人次旅客享受了這一便利模式，即在兩地邊檢手續「一次排隊、一次辦理」的便捷服務。
今年11月20日，拱北口岸啟用「免出示證件」通道，目前日均使用人數已達6萬餘人次，占口岸日通關量的近20%。
自2023年1月1日「澳車北上」政策實施以來，已有超過4.95萬名澳門駕駛員和3.78萬輛車輛完成邊檢備案手續。截至目前，超過252萬輛次「北上」澳門單牌車已經通過港珠澳大橋珠海公路口岸，佔該口岸小汽車通行總量的三成，成為通行的「主力軍」。
珠海邊檢總站負責人表示，為應對日益增長的客流和車流，邊檢部門持續優化通關措施，擴大橫琴口岸快捷查驗通道的通行範圍，並落實琴澳旅遊、港珠澳大橋珠海公路口岸“貨兼客”等措施，以有效提高口岸通行效率。
